ศาลเจ้าพ่อครุฑ แห่งนี้ ตั้งอยู่ในตรอกเล็กๆ ชื่อว่า “ตรอกครุฑ” ที่อยู่ระหว่างบนถนนอัษฎางค์
(บริเวณคลองหลอด) ตัดกับถนนบูรณศาสตร์ บริเวณตรงหน้าศาลเจ้าพ่อครุฑเดิมเมื่อ 100 กว่าปีก่อน
ยังเป็นร่องน้ำลึกประมาณครึ่งลำตัวซึ่งเชื่อมต่อมาจากคลองหลอด ต่อมาทางราชการได้ทำถนนผ่านเข้าออก ทำไมไม่เห็นสภาพร่องน้ำอย่างแต่เดิม ชาวบ้านในชุมชุนตรอกครุฑเล่าว่า เมื่อก่อนยังไม่มีศาลเจ้าพ่อครุฑ
ยังไม่มีชื่อตรอกครุฑอย่างปัจจุบัน ต่อมาปรากฏว่าน้ำได้พัดพาครุฑไม้แกะสลักสีดำเมี่ยม
(สันนิษฐานว่าเป็นครุฑไม้ที่ติดกับหัวเรือรบสมัยโบราณ) พร้อมกับหัวจระเข้ 2 หัว ลอยมาตามร่องน้ำ
และมาหยุดอยู่ตรงบริเวณที่ตั้งศาลเจ้าพ่อครุฑนี้
ชาวบ้านจึงช่วยกันสร้างศาลขึ้นและนำครุฑไม้ไปประดิษฐ์ฐานเพื่อสักการะ บูชา ขอพร เรียกว่า “ศาลเจ้าพ่อครุฑ” นับแต่นั้นมาบริเวณนี้จึงถูกเรียกว่า “ตรอกครุฑ” แต่ทว่าเมื่อราว 50 ปีก่อน ครุฑไม้แกะสลักเดิมได้หายไป
ทางกรมศิลปากรจึงได้แกะสลักครุฑองค์ใหม่ขึ้นนำมาประดิษฐ์ฐานแทนที่ครุฑไม้องค์เดิมที่หายไป

ต่อมา พ.ศ. 2559 พระอาจารย์วราห์ ปุญญวโร แห่งวัดโพธิ์ทอง บางมด กรุงเทพมหานคร
พระเกจิผู้สร้างวัตถุมงคลพญาครุฑแห่งวัดโพธิ์ทองซึ่งมีชื่อเสียงโด่งดังในปัจจุบัน ได้มาทำการบูรณะ
ศาลเจ้าพ่อครุฑและได้สร้างครุฑองค์ใหญ่อีกองค์หนึ่งมาประดิษฐ์ฐานคู่กับครุฑองค์เดิมที่ทางกรมศิลป์
นำมาประดิษฐ์ฐานไว้แทนครุฑไม้แกะสลักที่หายไปเมื่อ 50 ปีก่อน พร้อมจัดงานบวงสรวงขึ้นใน
วันอาทิตย์ที่ 17 เมษายน 2559

ปัจจุบัน ศาลเจ้าพ่อครุฑ มีบุคคลทั้งในชุมชนตรอกครุฑและชุมชนใกล้เคียงรวมถึงบุคคลทั่วไปทั้งชาวไทยและชาวต่างชาตินิยมมากราบไหว้บูชาและขอพรเพื่อความเป็นสิริมงคล โดยเฉพาะด้านเงินทอง โชคลาภ ขจัดสิ่งอัปมงคลทั้งหลาย และปกป้องให้รอดพ้นจากไฟไหม้ เป็นต้น นอกจากนี้ บริเวณหน้าศาลเจ้าพ่อครุฑยังมีการให้เช่าวัตถุมงคลเกี่ยวกับองค์พญาครุฑ อีกด้วย